經(jīng)過厚生省官員白鳥圭輔（仲村亨飾）和東城大學(xué)附屬醫(yī)院醫(yī)生田口公平（伊藤淳史飾）的努力，日本引進(jìn)首臺新型核磁共振成像儀器"利維坦"。與此同時(shí)，某高級別墅地下室發(fā)生九人離奇死亡事件，其中厚生省唯一支持引進(jìn)利維坦的船橋?qū)徸h官死于現(xiàn)場。海歸教授東堂文昭（生瀬勝久飾）利用利維坦查明死因?yàn)榍杌镏卸荆瑓s因異常執(zhí)著引發(fā)白鳥對其動機(jī)的懷疑。在Ai中心研討會前夕，田口收到威脅摧毀"三頭犬之塔"——利維坦的恐嚇信，通過與記者別宮葉子（桐谷美玲飾）的合作調(diào)查，發(fā)現(xiàn)系列事件矛頭指向因白鳥圭輔過往醫(yī)療決策而家破人亡的櫻宮堇（栗山千明飾）。隨著倒計(jì)時(shí)推進(jìn)，白鳥與田口在Ai中心展開生死對峙，最終通過解除炸彈裝置使利維坦得以保存。櫻宮堇在與白鳥當(dāng)面對質(zhì)后選擇自殺，其遺言揭露了醫(yī)療體系深層矛盾對個(gè)體命運(yùn)的殘酷碾壓。