《星球大戰：異等小隊第一季》講述了克隆人戰爭剛結束后，基因突變導致特殊能力的精英實驗性克隆人小隊"殘次品"在劇變中的銀河系尋找生存方向的故事。這支由達沃、獵人、技師、哨兵和醫療兵組成的獨特隊伍，在被迫為新生的銀河共和國執行高風險任務時，既要應對帝國殘余勢力對實驗性克隆人的追捕，又面臨自身基因突變引發的生理與道德困境。隨著執行追蹤失蹤克隆人士兵、解救被囚禁絕地圣殿武士等任務，他們逐漸發現新共和國高層仍在延續舊體制對克隆人的利用本質。在星際逃亡與對抗中，每位成員憑借狙擊、黑客、偽裝等特殊技能突破險境的同時，也必須直面作為實驗品被設計的命運，在群體身份認同與個體自由意志間尋求平衡。