近未來的日本，政府頒布全面禁止體罰學生的法令，但校園秩序隨之失控，欺凌與不公肆虐。為應對這一危機，政府秘密推行"假面教師計劃"，允許戴面具的特別教師對頑劣學生實施暴力懲戒。荒木剛太（藤ヶ谷太輔飾）曾是該計劃成員，但經歷某次事件后對自身行為產生懷疑，轉而選擇以真誠感化學生。此時，剛太高中時代的恩師羅門公平（遠藤憲一飾）調任華空學院，這位曾以溫情教育改變無數自暴自棄學生的教師，如今卻通過高壓手段維持校園秩序。隨著調查深入，剛太發現羅門的鐵腕統治實為受制于教育部門脅迫——其研發的情感動員教學法若無法在限定學期內見效，整個學校將被強制廢校。最終對決中，剛太聯合學生揭露教育部門陰謀，并以非暴力方式喚醒羅門對教育初心的堅守，假面教師制度由此迎來根本性變革。