深深海基地因傳說中的海怪襲擾啟動抓捕計劃，潛艇駕駛員逗號與伙伴們奉命展開調查。在探查過程中，他們意外發現所謂海怪竟是一只與龍媽媽失散的小龍。面對基地追捕行動帶來的威脅，逗號一行人深入危機四伏的深海洞穴，在躲避機械捕撈裝置的同時設法與小龍建立信任。通過解讀遠古壁畫傳遞的共生信號，眾人最終引導小龍釋放特殊生物熒光，成功喚回其母親。龍族現身時散發的次聲波消解了基地防護系統，雙方在目睹幼龍與母親團聚的溫情場景后達成和解。事件結束后，深深海基地重新修訂生態保護條例，而逗號團隊駕駛的潛艇也因搭載生物共鳴裝置成為連接人與海洋神秘生物的新橋梁。