雨果和父親大山生活在一個普通村莊里，但她卻擁有一個不為人知的秘密——她曾進入與人類世界平行的神秘世界。這個由神創造的空間里，普通人停留三天后會變成動物，每年會有99只動物被選為族民，而族長是雨果最好的朋友、一只名為啦啦的奇特生物。自幼缺失母親陪伴的雨果始終相信母親在進行科考，直到發現所有信件都被大山私自藏匿。得知母親當年因發現神秘世界而失蹤的真相后，雨果與父親重返這個充滿奇幻生物的空間。重逢的老朋友們正分享著各自的成長，啦啦的法術突飛猛進，熊大叔則陷入對功夫高手蘭首領的情愫。然而一只癲狂企鵝的警告打破了歡樂氛圍——惡龍已侵入神之領地，整個神秘世界面臨崩解危機。為尋找母親下落并拯救即將毀滅的奇幻家園，雨果與伙伴們踏上揭露古老預言真相、直面失控巨龍力量的冒險征程。