標本管理員鄒啟之因里島盲魚標本意外損壞，不顧臺風預警強行登島修復。剛抵達即遭遇裝有尸體的密封木箱被海浪沖上岸，島上實習警員王子軒臨危受命展開調查。隨著驗尸發現死者為外來入侵者且木箱刻有數字"123"，兩人逐步揭開島嶼實驗室二十年前的塵封往事。調查期間第二具刻有"234"標記的尸體出現，臺風帶來的斷電事故使監控失效。通過比對舊檔案與標本室密道，兩人發現死者均與當年非法生物實驗有關。當刻著"345"的第三個木箱在風暴高潮時現身，真相指向利用臺風周期實施復仇的幸存者。最終在實驗室崩塌前夜，鄒啟之用標本修復技術還原關鍵證據，協助王子軒鎖定兇手身份。