三年前的8月31日，“侵略者”巨大的母艦突如其來地降臨在東京，眼看這個世界即將迎來末日。自此之后，絕望漸漸地融入了日常生活；大大的飛碟盤旋于空中，今天也依然不變地持續環繞著世界。而在還沒有來到世界末日的此刻，小山門出、中川凰蘭這兩個高中女生的青春時代才正要展開。隨著母艦核心秘密的揭露，人類最后的抵抗力量在廢墟中集結，兩位少女被迫直面吞噬世界的機械巨獸與埋藏其深處的真相。當侵略者的終極武器啟動倒計時，她們必須在生存與毀滅之間做出抉擇——這場關乎人類存亡的戰斗，終將以血與光劃下句點。