古生物學家凱麗（布里吉特·芳達飾）為調查離奇死亡事件來到古老湖泊，發現湖底存在未知生物的跡象。她的推斷在小鎮引發分歧，直到游客被不明物體拖入水中慘劇發生，眾人終于正視危機。凱麗與管理員杰克（比爾·普爾曼飾）、警長漢克（布萊丹·格里森飾）組成調查小組，通過潛水探測確認湖底棲息著一只體長超過八米的遠古鱷魚。這只存活兩百年的史前生物因棲息地被侵蝕而開始攻擊人類，團隊在沼澤向導（奧利弗·普萊特飾）協助下鎖定其巢穴。最終行動中，漢克為引爆炸藥與巨鱷同歸于盡，杰克和凱麗成功引爆陷阱使洞穴坍塌，將鱷魚永久封印在湖底巖層。事后政府對湖泊實施封鎖，事件相關記錄被列為特殊檔案保存。