在地球生命起源之初，一枚細胞分裂為三份，最終進化成名為貝姆（龜梨和也飾）、貝拉（杏飾）和貝羅（鈴木福飾）的三個"妖怪人"。他們雖擁有丑陋外表卻秉持善良正義，竭力幫助人類卻始終遭受誤解與排斥。在被迫第127次搬家后，最小的貝羅偶遇因母親小百合（觀月亞理莎飾）去世而孤僻的小滿（畠山彩奈飾），純真友誼讓三兄妹首次感受到人間溫暖。與此同時，小滿父親（筒井道隆飾）供職的MPL制藥公司接連發生職員離奇死亡事件，令熱血刑警夏目（北村一輝飾）再度與妖怪人重逢。調查中眾人意外發現本應死亡的小百合仍以實驗體身份存活，由此揭開MPL利用遠古細胞進行非法人體實驗的真相。三兄妹在揭露陰謀過程中得知自己誕生于該實驗室最早期失敗品，最終選擇以非人類的身份繼續守護世界，并在朝陽下踏上新的旅程。