桐生大古與空蟬丸為了追擊入侵地球的宇蟲王達古迭多而踏上征程。然而在與達古迭多戰斗時，空蟬丸被扔去了另一個時空的地球在那里，人類未能從達古迭多手中救下宇宙，地球最終被亡領軍占領。為了防止出現這樣荒蕪的未來，他們再度踏上時空之旅。但更改歷史對時空產生了影響，地球上的基拉成為了新的宇蟲王……！