在美國人民逐步屈服于祖國人統治的高壓社會下，戈多金大學迎來激進改革派校長雷蒙德·萊恩，其推行的"涅墨西斯計劃"通過神經植入技術強化學生超能力。凱特與山姆因揭露沃特國際陰謀被塑造為國家英雄，但被迫接受校方監控；瑪麗、喬丹與艾瑪在經歷人體實驗創傷后重返校園，發現超人類學生群體已分化為激進反抗派與體制合作派。當人類與超人類的暴力沖突在各地爆發時，三人意外解密了冷戰時期"星塵行動"的檔案殘片——這項始于1960年代、由沃特與軍方聯合實施的基因改造工程，不僅制造了首批可控超人類士兵，其后續實驗體瑪麗體內潛伏的納米機器人更成為破解當前社會危機的關鍵。隨著校園內覺醒者與植入體使用者的對立升級，瑪麗逐漸意識到自己既是歷史罪行的活體證據，也是未來戰爭走向的核心變量。