富家少爺郝笑文（郝劭文飾）帶著半路結識的“侍女”丑妹，與釋小寶、小瑩一同考入忍者學校。這所功利主義的學府因笑文家世背景破例錄取，而釋小寶和小瑩則憑借實力通過考核。在忍術導師一元（吳孟達飾）與二次先生的指導下，四個少年將手里劍訓練、潛水課程乃至日常飲食演化成連環笑料。他們更以催淚彈為"賺錢武器"，甚至讓校長（黃一飛飾）淪為惡作劇受害者。某日神秘忍者（許效舜飾）突襲校園，此人原是十年前敗于一元之手的武士。為協助其完成復仇挑戰，少年們運用所學忍術與惡作劇天賦，在訓練成果與意外狀況間制造連環奇招。面對昔日宿敵的復仇執念，一元通過指導學生重拾忍者之道真諦。最終少年們以非常規方式化解危機，使校園恢復平靜的同時，也讓傳統忍術與現代童趣達成微妙平衡。