一支深海潛艇科考隊在執行探測任務時意外發現海底裂縫中的未知入口，穿越后進入一個被遺忘的水下文明遺跡。他們驚恐地喚醒了沉睡其中的遠古異形生物群落，這些擁有熒光紋理與超自然感知力的生物開始對入侵者展開獵殺。隨著潛艇動力系統受損，科考隊員在氧氣即將耗盡的絕境中被迫深入遺跡核心區，在破解發光符號謎題的過程中，逐漸意識到這些生物實為地球史前文明的幸存者。當異形族群首領通過顱骨共鳴展示人類基因污染導致海洋生態崩潰的未來圖景時，幸存者們必須做出抉擇：要么啟動遺跡自毀程序與威脅同歸于盡，要么冒險釋放被封印的遠古海洋凈化系統。