綾香市已有一年未出現怪獸，湊家三兄妹各自追尋夢想：弟弟勇海與妹妹朝陽在羅布水晶力量的引導下逐步成長，哥哥活海卻陷入人生迷惘。為尋求突破，活海探訪高中摯友戶井，卻發現對方同樣頹廢不堪。托雷基亞趁虛而入，利用二人內心封閉的裂隙植入黑暗力量，使活海墜入邪念深淵并逃離地球。與此同時，被邪惡能量喚醒的遠古怪獸黑蜧現身都市，勇海與來自平行世界的捷德奧特曼小陸聯手迎戰。隨著真相揭曉，托雷基亞的真實身份——被放逐的光之國叛將浮出水面，其陰謀直指羅布水晶的核心力量。活海在異星被黑暗能量改造為托雷基亞的傀儡戰士，與親弟弟妹展開對決。最終三兄妹通過水晶共鳴喚醒羈絆之力，在光暗能量的終極碰撞中擊潰托雷基亞的陰謀，破碎的家庭在星光與勇氣中重獲新生。