在清朝雍正年間，少林寺內接連發生離奇命案，數名弟子神秘死亡，三十六代、三十七代掌門相繼遇害。康熙御賜的墨玉香爐被盜后，所有疑點指向俗家弟子雷鵬飛（黃家達飾）。雍正帝借機施壓，派遣玉格格（龍君兒飾）前往少林寺追查盜寶者。現任掌門圓慧（魯平飾）被迫承諾：若限期未破案則焚毀少林寺并自盡。雷鵬飛在師祖田智（張翼飾）和女俗家弟子柳芝蘭（上官靈鳳飾）協助下展開調查，最終揭露真兇竟是掌門圓慧。然而案件另有隱情——隨著真相浮出水面，雷鵬飛發現圓慧與清廷存在秘密勾結，其殺害弟子、盜取御賜寶物的真實目的是為協助朝廷徹底鏟除少林勢力。在持續追查過程中，三人逐步瓦解了圓慧及其幕后勢力的多重陰謀，最終成功保全少林寺并終結這場蓄謀已久的權力斗爭。