杰西（杰森·詹姆斯·里希特飾）成年后加入海岸科考隊(duì)，與回歸海洋家園的座頭鯨威利重逢。某次巡邏中他意外介入非法捕鯨者約翰（帕特里克·基爾帕特里克飾）對(duì)威利的獵捕行動(dòng)——約翰慣于帶兒子麥克斯（Vincent Berry飾）同行，使男孩對(duì)鯨群既親近又矛盾。沖突升級(jí)時(shí)威利被困漁網(wǎng)瀕臨窒息，杰西及時(shí)解救并帶麥克斯見(jiàn)證海洋生態(tài)的脆弱。盡管父親執(zhí)意繼續(xù)捕鯨，威利卻在暴風(fēng)雨中主動(dòng)營(yíng)救落水的約翰。這場(chǎng)生死救援徹底動(dòng)搖了麥克斯對(duì)捕鯨業(yè)的認(rèn)知，最終促使約翰在兒子與威利的見(jiàn)證下親手焚毀捕鯨船。電影以鯨群鳴叫呼應(yīng)人類與自然關(guān)系的轉(zhuǎn)變，延續(xù)該系列對(duì)跨物種友誼的刻畫。